Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP19O94966 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP19O94966 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP19O94966 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP19O94966 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP19O94966 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP19O94966 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP19O94966 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP19O94966 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP19O94966 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP19O94966 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP19O94966 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP19O94966 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP19O94966 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP19O94966 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP19O94966 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP19O94966 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
USP19O94966 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP19O94966 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP19O94966 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
USP19O94966 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP19O94966 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP19O94966 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP19O94966 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP19O94966 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP19O94966 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP19O94966 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP19O94966 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP19O94966 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP19O94966 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP19O94966 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP19O94966 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP19O94966 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP19O94966 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
USP19O94966 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP19O94966 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP19O94966 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP19O94966 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP19O94966 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP19O94966 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP19O94966 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP19O94966 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP19O94966 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP19O94966 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP19O94966 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP19O94966 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP19O94966 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP19O94966 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP19O94966 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP19O94966 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
USP19O94966 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP19O94966 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP19O94966 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP19O94966 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP19O94966 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP19O94966 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP19O94966 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP19O94966 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP19O94966 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP19O94966 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP19O94966 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP19O94966 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP19O94966 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP19O94966 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP19O94966 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP19O94966 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP19O94966 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP19O94966 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms