Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPREB3Q9UKI3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPREB3Q9UKI3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms