Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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