Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC62Q6P9F0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms