Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSBN1Q5VWQ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSBN1Q5VWQ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSBN1Q5VWQ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSBN1Q5VWQ0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSBN1Q5VWQ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSBN1Q5VWQ0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms