Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3C1V9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3C1V9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3C1V9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3C1V9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3C1V9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3C1V9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3C1V9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3C1V9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3C1V9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3C1V9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3C1V9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3C1V9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3C1V9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3C1V9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3C1V9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3C1V9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3C1V9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3C1V9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3C1V9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3C1V9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3C1V9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3C1V9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3C1V9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3C1V9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3C1V9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3C1V9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3C1V9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3C1V9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3C1V9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3C1V9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3C1V9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3C1V9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3C1V9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3C1V9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3C1V9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3C1V9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3C1V9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3C1V9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3C1V9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3C1V9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3C1V9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3C1V9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3C1V9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3C1V9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3C1V9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3C1V9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3C1V9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3C1V9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3C1V9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3C1V9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3C1V9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3C1V9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3C1V9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q3C1V9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3C1V9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3C1V9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3C1V9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3C1V9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3C1V9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3C1V9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3C1V9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms