Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
SPAG9O60271 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
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