Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARID3CA6NKF2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ARID3CA6NKF2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARID3CA6NKF2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms