Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXD3Q9UJU5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXD3Q9UJU5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms