Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP30Q70CQ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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