Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2C1P98194 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2C1P98194 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms