Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 SPC2YML055W 537 nt3.59□□□□□ -1.83
NDI1P32340 RIB4YOL143C 510 nt3.59□□□□□ -1.83
NDI1P32340 SYC1YOR179C 567 nt3.59□□□□□ -1.83
NDI1P32340 FYV5YCL058C 459 nt3.59□□□□□ -1.83
NDI1P32340 YPR148CYPR148C 1308 nt3.59□□□□□ -1.83
NDI1P32340 SUP45YBR143C 1314 nt3.59□□□□□ -1.83
NDI1P32340 SDS23YGL056C 1584 nt3.59□□□□□ -1.84
NDI1P32340 APN2YBL019W 1563 nt3.59□□□□□ -1.84
NDI1P32340 XRS2YDR369C 2565 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 CUE3YGL110C 1875 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 VPS53YJL029C 2469 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YDR526CYDR526C 471 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 PFS1YHR185C 714 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 RFA3YJL173C 369 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 GPN3YLR243W 819 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 RIM11YMR139W 1113 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 PFK27YOL136C 1194 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 snR44snR44 211 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 RIB5YBR256C 717 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 PLM2YDR501W 1566 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 TAF1YGR274C 3201 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 CET1YPL228W 1650 nt3.58□□□□□ -1.84
NDI1P32340 MEI4YER044C-A 1227 nt3.57□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YKR070WYKR070W 1059 nt3.57□□□□□ -1.84
NDI1P32340 REH1YLR387C 1299 nt3.57□□□□□ -1.84
NDI1P32340 COS1YNL336W 1146 nt3.57□□□□□ -1.84
NDI1P32340 STD1YOR047C 1335 nt3.57□□□□□ -1.84
NDI1P32340 RPB8YOR224C 441 nt3.57□□□□□ -1.84
NDI1P32340 ISM1YPL040C 3009 nt3.57□□□□□ -1.84
NDI1P32340 PHO5YBR093C 1404 nt3.57□□□□□ -1.84
NDI1P32340 SLA1YBL007C 3735 nt3.57□□□□□ -1.84
NDI1P32340 DAN4YJR151C 3486 nt3.57□□□□□ -1.84
NDI1P32340 OSH3YHR073W 2991 nt3.57□□□□□ -1.84
NDI1P32340 OAF3YKR064W 2592 nt3.57□□□□□ -1.84
NDI1P32340 SEC6YIL068C 2418 nt3.56□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YJR061WYJR061W 2808 nt3.56□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YIG1YPL201C 1386 nt3.56□□□□□ -1.84
NDI1P32340 CBS2YDR197W 1170 nt3.56□□□□□ -1.84
NDI1P32340 KXD1YGL079W 657 nt3.56□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YGR026WYGR026W 837 nt3.56□□□□□ -1.84
NDI1P32340 PSF2YJL072C 642 nt3.56□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YOR082CYOR082C 342 nt3.56□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YOR263CYOR263C 408 nt3.56□□□□□ -1.84
NDI1P32340 TYE7YOR344C 876 nt3.56□□□□□ -1.84
NDI1P32340 GPI1YGR216C 1830 nt3.56□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YHR202WYHR202W 1809 nt3.56□□□□□ -1.84
NDI1P32340 AEP3YPL005W 1821 nt3.56□□□□□ -1.84
NDI1P32340 ARO1YDR127W 4767 nt3.55□□□□□ -1.84
NDI1P32340 CPA2YJR109C 3357 nt3.55□□□□□ -1.84
NDI1P32340 STU1YBL034C 4542 nt3.55□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.55□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.55□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YNL035CYNL035C 1170 nt3.55□□□□□ -1.84
NDI1P32340 DUG3YNL191W 1074 nt3.55□□□□□ -1.84
NDI1P32340 TIR2YOR010C 756 nt3.55□□□□□ -1.84
NDI1P32340 FDH1YOR388C 1131 nt3.55□□□□□ -1.84
NDI1P32340 SEC59YMR013C 1560 nt3.55□□□□□ -1.84
NDI1P32340 CAF130YGR134W 3369 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 SNU23YDL098C 585 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 PDS1YDR113C 1122 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YPR1YDR368W 939 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 ERJ5YFR041C 888 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 PDX1YGR193C 1233 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 GEP4YHR100C 558 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 IRC18YJL037W 675 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YJR111CYJR111C 852 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YLR339CYLR339C 552 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 IPP1YBR011C 864 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 SLM2YNL047C 1971 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YPL109CYPL109C 1974 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 GPI13YLL031C 3054 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 JEN1YKL217W 1851 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 ASI1YMR119W 1875 nt3.54□□□□□ -1.84
NDI1P32340 TRM12YML005W 1389 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 BSC1YDL037C 987 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 BSC2YDR275W 708 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 IZH1YDR492W 951 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 RPL22BYFL034C-A 369 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YFR057WYFR057W 456 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 YOL107WYOL107W 1029 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 DIB1YPR082C 432 nt3.53□□□□□ -1.84
NDI1P32340 ALA1YOR335C 2877 nt3.53□□□□□ -1.85
NDI1P32340 DSS1YMR287C 2910 nt3.52□□□□□ -1.85
NDI1P32340 COM2YER130C 1332 nt3.52□□□□□ -1.85
NDI1P32340 FKH2YNL068C 2589 nt3.52□□□□□ -1.85
NDI1P32340 DET1YDR051C 1005 nt3.52□□□□□ -1.85
NDI1P32340 RPA14YDR156W 414 nt3.52□□□□□ -1.85
NDI1P32340 YDR535CYDR535C 501 nt3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 257.2 ms