Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TNIKQ9UKE5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TNIKQ9UKE5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TNIKQ9UKE5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms