Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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RABGEF1Q9UJ41 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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RABGEF1Q9UJ41 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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RABGEF1Q9UJ41 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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RABGEF1Q9UJ41 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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RABGEF1Q9UJ41 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABGEF1Q9UJ41 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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