Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CGGBP1Q9UFW8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CGGBP1Q9UFW8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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