Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM106CQ9BVX2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms