Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM43Q96BQ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM43Q96BQ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.7 ms