Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF38BQ5VTL8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF38BQ5VTL8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms