Protein–RNA interactions for Protein: P53962

YNL035C, Uncharacterized WD repeat-containing protein YNL035C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL035CP53962 RCM1YNL022C 1473 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 YDR396WYDR396W 501 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 YIP4YGL198W 708 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 SPL2YHR136C 447 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 SDL1YIL167W 633 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 LSO1YJR005C-A 282 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 CSE4YKL049C 690 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 YOL114CYOL114C 609 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 YOR121CYOR121C 306 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 YJR015WYJR015W 1533 nt6.85□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 SSK22YCR073C 3996 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 VPS72YDR485C 2388 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 HXT3YDR345C 1704 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 RFT1YBL020W 1725 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 YDR131CYDR131C 1671 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 FET4YMR319C 1659 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 MTC5YDR128W 3447 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 NMD3YHR170W 1557 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 YCR013CYCR013C 648 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 YDL094CYDL094C 510 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 NGG1YDR176W 2109 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 BCP1YDR361C 852 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 GCG1YER163C 699 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 RPB9YGL070C 369 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 CRG1YHR209W 876 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 YIL060WYIL060W 435 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 LCB3YJL134W 1230 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 YML047W-AYML047W-A 366 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 TPM1YNL079C 600 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 RPL3YOR063W 1164 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 YPR039WYPR039W 336 nt6.84□□□□□ -1.31
YNL035CP53962 CCC2YDR270W 3015 nt6.84□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 ARP9YMR033W 1404 nt6.84□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 MRH4YGL064C 1686 nt6.84□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 PLB2YMR006C 2121 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YPR148CYPR148C 1308 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YDR102CYDR102C 333 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YFL051CYFL051C 483 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 MRPL9YGR220C 810 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 BIO2YGR286C 1128 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YBL112CYBL112C 318 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 GLN1YPR035W 1113 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 STT3YGL022W 2157 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 MID1YNL291C 1647 nt6.83□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 AVT7YIL088C 1473 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 MDH3YDL078C 1032 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YDL177CYDL177C 513 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YJL175WYJL175W 513 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 DAD2YKR083C 402 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YLR050CYLR050C 486 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 TAL1YLR354C 1008 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YNR005CYNR005C 405 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 MRPS12YNR036C 462 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 FSH3YOR280C 801 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YRO2YBR054W 1035 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 snR36snR36 182 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YKU70YMR284W 1809 nt6.82□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 DAL5YJR152W 1632 nt6.81□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YER175W-AYER175W-A 165 nt6.81□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 MRE11YMR224C 2079 nt6.81□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 RRP9YPR137W 1722 nt6.81□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 RFA1YAR007C 1866 nt6.81□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YCL068CYCL068C 783 nt6.8□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 COX9YDL067C 180 nt6.8□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 SNA4YDL123W 423 nt6.8□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 THI4YGR144W 981 nt6.8□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 CRH1YGR189C 1524 nt6.8□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 ENP2YGR145W 2124 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YCT1YLL055W 1596 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 PTC3YBL056W 1407 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 GUP2YPL189W 1830 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YPT32YGL210W 669 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YHL049CYHL049C 816 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 QCR10YHR001W-A 234 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YIR042CYIR042C 711 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 EMC2YJR088C 879 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 ATP18YML081C-A 180 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YMR122CYMR122C 375 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 THI2YBR240C 1353 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 RGT2YDL138W 2292 nt6.79□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 UTP11YKL099C 753 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 YMR252CYMR252C 405 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 LSC1YOR142W 990 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 AIM4YBR194W 372 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 NEL1YHR035W 1893 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 BNA5YLR231C 1362 nt6.78□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 TUB3YML124C 1338 nt6.77□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 PAM1YDR251W 2493 nt6.77□□□□□ -1.32
YNL035CP53962 IML2YJL082W 2196 nt6.77□□□□□ -1.33
YNL035CP53962 YCL065WYCL065W 369 nt6.77□□□□□ -1.33
YNL035CP53962 YGR164WYGR164W 336 nt6.77□□□□□ -1.33
YNL035CP53962 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt6.77□□□□□ -1.33
YNL035CP53962 ERP1YAR002C-A 660 nt6.77□□□□□ -1.33
YNL035CP53962 YBR113WYBR113W 483 nt6.77□□□□□ -1.33
YNL035CP53962 MSY1YPL097W 1479 nt6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.9 ms