Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00271P0C7V0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms