Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SPAG9O60271 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SPAG9O60271 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SPAG9O60271 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SPAG9O60271 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPAG9O60271 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms