Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROB1E7EW31 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROB1E7EW31 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROB1E7EW31 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PROB1E7EW31 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PROB1E7EW31 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PROB1E7EW31 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PROB1E7EW31 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PROB1E7EW31 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PROB1E7EW31 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PROB1E7EW31 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROB1E7EW31 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROB1E7EW31 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROB1E7EW31 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PROB1E7EW31 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PROB1E7EW31 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROB1E7EW31 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROB1E7EW31 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PROB1E7EW31 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PROB1E7EW31 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROB1E7EW31 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROB1E7EW31 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROB1E7EW31 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROB1E7EW31 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PROB1E7EW31 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PROB1E7EW31 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PROB1E7EW31 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PROB1E7EW31 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PROB1E7EW31 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROB1E7EW31 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROB1E7EW31 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PROB1E7EW31 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PROB1E7EW31 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PROB1E7EW31 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PROB1E7EW31 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PROB1E7EW31 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PROB1E7EW31 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PROB1E7EW31 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PROB1E7EW31 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROB1E7EW31 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PROB1E7EW31 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROB1E7EW31 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROB1E7EW31 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROB1E7EW31 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROB1E7EW31 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROB1E7EW31 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PROB1E7EW31 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROB1E7EW31 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PROB1E7EW31 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PROB1E7EW31 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PROB1E7EW31 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PROB1E7EW31 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PROB1E7EW31 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PROB1E7EW31 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PROB1E7EW31 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROB1E7EW31 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PROB1E7EW31 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROB1E7EW31 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROB1E7EW31 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PROB1E7EW31 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROB1E7EW31 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PROB1E7EW31 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PROB1E7EW31 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PROB1E7EW31 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROB1E7EW31 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PROB1E7EW31 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROB1E7EW31 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROB1E7EW31 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms