Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ARID3CA6NKF2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ARID3CA6NKF2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARID3CA6NKF2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms