Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DTX4Q9Y2E6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms