Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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RABGEF1Q9UJ41 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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RABGEF1Q9UJ41 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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RABGEF1Q9UJ41 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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RABGEF1Q9UJ41 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RABGEF1Q9UJ41 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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