Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf3Q8WVX3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms