Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL19A1Q14993 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL19A1Q14993 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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