Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	PFF1	YBR074W	2931 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SMC4	Q12267	YKL066W	YKL066W	444 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SMC4	Q12267	SME1	YOR159C	285 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SMC4	Q12267	CDC9	YDL164C	2268 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SMC4	Q12267	BPT1	YLL015W	4680 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SMC4	Q12267	RPL24B	YGR148C	468 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SMC4	Q12267	RPL14B	YHL001W	417 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SMC4	Q12267	URK1	YNR012W	1506 nt		3.84	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	RPN1	YHR027C	2982 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	YGR067C	YGR067C	2415 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	PEP1	YBL017C	4740 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	GRE3	YHR104W	984 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	MYO3	YKL129C	3819 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	MIC27	YNL100W	705 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	NAT5	YOR253W	531 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	SCD6	YPR129W	1050 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	SPS22	YCL048W	1392 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	SLM5	YCR024C	1479 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	YDL023C	YDL023C	321 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	DGK1	YOR311C	873 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	NPR3	YHL023C	3441 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	YDR537C	YDR537C	606 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	BET3	YKR068C	582 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	RBL2	YOR265W	321 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	YMR018W	YMR018W	1545 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	BOI1	YBL085W	2943 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	TGL1	YKL140W	1647 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	REV3	YPL167C	4515 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	YHB1	YGR234W	1200 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	YIL102C-A	YIL102C-A	228 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	NCE102	YPR149W	522 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	INP53	YOR109W	3324 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	MEF1	YLR069C	2286 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	BYE1	YKL005C	1785 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	BET1	YIL004C	429 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	SWR1	YDR334W	4545 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	DBF2	YGR092W	1719 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	YFR032C-B	YFR032C-B	264 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	TRI1	YMR233W	681 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	RPC19	YNL113W	429 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	YBR242W	YBR242W	717 nt		3.78	□□□□□ -1.8
SMC4	Q12267	SBE2	YDR351W	2595 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	DLS1	YJL065C	504 nt		3.77	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	YCR101C	YCR101C	549 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	YLR255C	YLR255C	354 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	YDL109C	YDL109C	1944 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	NUP170	YBL079W	4509 nt		3.76	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	APP1	YNL094W	1764 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	SAP190	YKR028W	3102 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	DYN1	YKR054C	12279 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	DOA4	YDR069C	2781 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	RPS16B	YDL083C	432 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	KIN28	YDL108W	921 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	GEP4	YHR100C	558 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	YKL169C	YKL169C	384 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	RSA1	YPL193W	1146 nt		3.75	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	PWP2	YCR057C	2772 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	QRI7	YDL104C	1224 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	RPS21B	YJL136C	264 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	IZH2	YOL002C	954 nt		3.74	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	PNC1	YGL037C	651 nt		3.73	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	MST27	YGL051W	705 nt		3.73	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	RTS1	YOR014W	2274 nt		3.73	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	POL12	YBL035C	2118 nt		3.73	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	YER039C-A	YER039C-A	219 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	YIL047C-A	YIL047C-A	369 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	FPR1	YNL135C	345 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	MCM16	YPR046W	546 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	HCM1	YCR065W	1695 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	KAP123	YER110C	3342 nt		3.72	□□□□□ -1.81
SMC4	Q12267	CNL1	YDR357C	369 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	ATP7	YKL016C	525 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	PPT2	YPL148C	522 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	MSH2	YOL090W	2895 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	MOB2	YFL034C-B	864 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	EMG1	YLR186W	759 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	YNR062C	YNR062C	984 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	MNR2	YKL064W	2910 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	VFA1	YER128W	612 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	SRB5	YGR104C	924 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	YOR055W	YOR055W	435 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	YOR277C	YOR277C	309 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	KEL2	YGR238C	2649 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	FAR1	YJL157C	2493 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	SRO77	YBL106C	3033 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	SPO73	YER046W	432 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	GIP3	YPL137C	3831 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	YBR085C-A	YBR085C-A	258 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	VPS13	YLL040C	9435 nt		3.68	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	CHS5	YLR330W	2016 nt		3.68	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	SUL1	YBR294W	2580 nt		3.68	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	PRP8	YHR165C	7242 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	YPL039W	YPL039W	951 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	POL2	YNL262W	6669 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	EDS1	YBR033W	2760 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	MET5	YJR137C	4329 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SMC4	Q12267	SRB8	YCR081W	4284 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SMC4	Q12267	CDC20	YGL116W	1833 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SMC4	Q12267	YBL065W	YBL065W	345 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SMC4	Q12267	YKR023W	YKR023W	1593 nt		3.64	□□□□□ -1.83

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