Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKCEQ02156 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCEQ02156 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms