Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMB2P55268 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMB2P55268 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMB2P55268 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMB2P55268 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMB2P55268 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMB2P55268 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMB2P55268 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMB2P55268 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LAMB2P55268 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMB2P55268 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms