Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM4AO75164 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM4AO75164 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4AO75164 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms