Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACOX3O15254 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACOX3O15254 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms