Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DTX4Q9Y2E6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DTX4Q9Y2E6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms