Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASS4Q9NQ75 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms