Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM106CQ9BVX2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms