Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC47Q96A33 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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