Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRIP3Q6Q6R5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRIP3Q6Q6R5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms