Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNI3KQ59H18 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI3KQ59H18 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms