Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NEDD8Q15843 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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NEDD8Q15843 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NEDD8Q15843 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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