Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD1Q15797 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD1Q15797 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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