Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YNL320WYNL320W 855 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 RET3YPL010W 570 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 DIM1YPL266W 957 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 CCL1YPR025C 1182 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 RRP7YCL031C 894 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 PTA1YAL043C 2358 nt4.06□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 TRF5YNL299W 1929 nt4.05□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 UPC2YDR213W 2742 nt4.05□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YDL094CYDL094C 510 nt4.05□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 SHU2YDR078C 672 nt4.05□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YGL088WYGL088W 366 nt4.05□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 CWC23YGL128C 852 nt4.05□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YJL218WYJL218W 591 nt4.05□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 ATG34YOL083W 1239 nt4.05□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YOR338WYOR338W 1092 nt4.05□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 snR44snR44 211 nt4.05□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 RIA1YNL163C 3333 nt4.05□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 ARO80YDR421W 2853 nt4.05□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 SAT4YCR008W 1812 nt4.05□□□□□ -1.76 RIP-Chip
PUF2Q12221 PHO87YCR037C 2772 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YCL076WYCL076W 744 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 HSP42YDR171W 1128 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YFL019CYFL019C 354 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 RPL22BYFL034C-A 369 nt4.04□□□□□ -1.76 RIP-Chip
PUF2Q12221 CNN1YFR046C 1086 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 AIM18YHR198C 966 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 DCS1YLR270W 1053 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 TDA5YLR426W 981 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 TAP42YMR028W 1101 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 MRPS17YMR188C 714 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YNL050CYNL050C 813 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 RPL18BYNL301C 561 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 MGE1YOR232W 687 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 RRP36YOR287C 903 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YBR063CYBR063C 1215 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 snR37snR37 386 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 PDR5YOR153W 4536 nt4.04□□□□□ -1.76 RIP-Chip
PUF2Q12221 PMC1YGL006W 3522 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 AIM21YIR003W 2040 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 IDS2YJL146W 1410 nt4.04□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt4.03□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 OPT2YPR194C 2634 nt4.03□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 ALR2YFL050C 2577 nt4.03□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 QRI7YDL104C 1224 nt4.03□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 NBP2YDR162C 711 nt4.03□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 RAV2YDR202C 1056 nt4.03□□□□□ -1.76 RIP-Chip
PUF2Q12221 SRB7YDR308C 423 nt4.03□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 SRB5YGR104C 924 nt4.03□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 YBR053CYBR053C 1077 nt4.03□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 OM14YBR230C 405 nt4.03□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 RRN11YML043C 1524 nt4.03□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 TPA1YER049W 1935 nt4.03□□□□□ -1.76
PUF2Q12221 SPO1YNL012W 1896 nt4.03□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SYF1YDR416W 2580 nt4.03□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YFL040WYFL040W 1623 nt4.03□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 PTR3YFR029W 2037 nt4.02□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 MEI4YER044C-A 1227 nt4.02□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.02□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 INA17YPL099C 549 nt4.02□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 ALE1YOR175C 1860 nt4.02□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 NAM2YLR382C 2685 nt4.02□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 UGA3YDL170W 1587 nt4.02□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SSH1YBR283C 1473 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 FAS2YPL231W 5664 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 VAC17YCL063W 1272 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 ISC10YER180C 804 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YGL152CYGL152C 678 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 PFS1YHR185C 714 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 HIS5YIL116W 1158 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YKR051WYKR051W 1257 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 GPI12YMR281W 915 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 DCS2YOR173W 1062 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 UAF30YOR295W 687 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SAG1YJR004C 1953 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YSH1YLR277C 2340 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 LTV1YKL143W 1392 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SKG6YHR149C 2205 nt4.01□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YJR061WYJR061W 2808 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 TRE2YOR256C 2430 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SPT15YER148W 723 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YGL117WYGL117W 798 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 ARC15YIL062C 465 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 BAT2YJR148W 1131 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 MMM1YLL006W 1281 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SFH1YLR321C 1281 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 FLD1YLR404W 858 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 TEM1YML064C 738 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SRT1YMR101C 1032 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SME1YOR159C 285 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 JID1YPR061C 906 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YBR287WYBR287W 1284 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 UBP10YNL186W 2379 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 ROD1YOR018W 2514 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 CTK1YKL139W 1587 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 MGA1YGR249W 1371 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 SPT14YPL175W 1359 nt4□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 TOG1YER184C 2385 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YER077CYER077C 2067 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 YRB30YGL164C 1323 nt3.99□□□□□ -1.77
PUF2Q12221 RPN4YDL020C 1596 nt3.99□□□□□ -1.77 RIP-Chip
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