Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POU5F1Q01860 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms