Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC24CP53992 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24CP53992 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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