Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 YIR014WYIR014W 729 nt3.77□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.77□□□□□ -1.81
SEC28P40509 MDJ2YNL328C 441 nt3.77□□□□□ -1.81
SEC28P40509 SNF8YPL002C 702 nt3.77□□□□□ -1.81
SEC28P40509 MRPL51YPR100W 423 nt3.77□□□□□ -1.81
SEC28P40509 PPQ1YPL179W 1650 nt3.77□□□□□ -1.81
SEC28P40509 IGO2YHR132W-A 396 nt3.76□□□□□ -1.81
SEC28P40509 IRC18YJL037W 675 nt3.76□□□□□ -1.81
SEC28P40509 UTP11YKL099C 753 nt3.76□□□□□ -1.81
SEC28P40509 COQ5YML110C 924 nt3.76□□□□□ -1.81
SEC28P40509 RET3YPL010W 570 nt3.76□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YPL088WYPL088W 1029 nt3.76□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YPR136CYPR136C 513 nt3.76□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt3.76□□□□□ -1.81
SEC28P40509 GAC1YOR178C 2382 nt3.75□□□□□ -1.81
SEC28P40509 KEG1YFR042W 603 nt3.75□□□□□ -1.81
SEC28P40509 ENT3YJR125C 1227 nt3.75□□□□□ -1.81
SEC28P40509 ERP1YAR002C-A 660 nt3.75□□□□□ -1.81
SEC28P40509 DSC2YOL073C 969 nt3.75□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YOR365CYOR365C 2112 nt3.75□□□□□ -1.81
SEC28P40509 ACK1YDL203C 1872 nt3.75□□□□□ -1.81
SEC28P40509 HDA2YDR295C 2025 nt3.75□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YTM1YOR272W 1383 nt3.75□□□□□ -1.81
SEC28P40509 ENT5YDR153C 1236 nt3.74□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YHP1YDR451C 1062 nt3.74□□□□□ -1.81
SEC28P40509 TLG1YDR468C 675 nt3.74□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YLR177WYLR177W 1887 nt3.74□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YMR310CYMR310C 954 nt3.74□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YNL234WYNL234W 1281 nt3.74□□□□□ -1.81
SEC28P40509 OSW1YOR255W 837 nt3.74□□□□□ -1.81
SEC28P40509 OXR1YPL196W 822 nt3.74□□□□□ -1.81
SEC28P40509 BCS1YDR375C 1371 nt3.74□□□□□ -1.81
SEC28P40509 ROD1YOR018W 2514 nt3.74□□□□□ -1.81
SEC28P40509 PRP31YGR091W 1485 nt3.73□□□□□ -1.81
SEC28P40509 AVT7YIL088C 1473 nt3.73□□□□□ -1.81
SEC28P40509 CEX1YOR112W 2286 nt3.73□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YPR022CYPR022C 3402 nt3.73□□□□□ -1.81
SEC28P40509 SEC53YFL045C 765 nt3.73□□□□□ -1.81
SEC28P40509 TYS1YGR185C 1185 nt3.73□□□□□ -1.81
SEC28P40509 FLD1YLR404W 858 nt3.73□□□□□ -1.81
SEC28P40509 COS1YNL336W 1146 nt3.73□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YOR082CYOR082C 342 nt3.73□□□□□ -1.81
SEC28P40509 SSU1YPL092W 1377 nt3.73□□□□□ -1.81
SEC28P40509 SIN4YNL236W 2925 nt3.73□□□□□ -1.81
SEC28P40509 HEF3YNL014W 3135 nt3.73□□□□□ -1.81
SEC28P40509 PMT6YGR199W 2280 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 QRI7YDL104C 1224 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 BMH1YER177W 804 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 AML1YGR001C 747 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YPT35YHR105W 645 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 SOP4YJL192C 705 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 LDS2YOL047C 1071 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 MUM2YBR057C 1101 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 NTA1YJR062C 1374 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 DSS1YMR287C 2910 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 AEP2YMR282C 1743 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 COP1YDL145C 3606 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 APE2YKL157W 2859 nt3.72□□□□□ -1.81
SEC28P40509 MSS4YDR208W 2340 nt3.71□□□□□ -1.82
SEC28P40509 RAD26YJR035W 3258 nt3.71□□□□□ -1.82
SEC28P40509 RPS29BYDL061C 171 nt3.71□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YDR149CYDR149C 708 nt3.71□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.71□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YHR173CYHR173C 339 nt3.71□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YJR096WYJR096W 849 nt3.71□□□□□ -1.82
SEC28P40509 OMA1YKR087C 1038 nt3.71□□□□□ -1.82
SEC28P40509 BUR2YLR226W 1188 nt3.71□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YAR075WYAR075W 474 nt3.71□□□□□ -1.82
SEC28P40509 PFK27YOL136C 1194 nt3.71□□□□□ -1.82
SEC28P40509 SUR1YPL057C 1149 nt3.71□□□□□ -1.82
SEC28P40509 ZDS2YML109W 2829 nt3.71□□□□□ -1.82
SEC28P40509 RDS1YCR106W 2499 nt3.71□□□□□ -1.82
SEC28P40509 RAD4YER162C 2265 nt3.7□□□□□ -1.82
SEC28P40509 RNR1YER070W 2667 nt3.7□□□□□ -1.82
SEC28P40509 CPA2YJR109C 3357 nt3.7□□□□□ -1.82
SEC28P40509 SWH1YAR042W 3567 nt3.7□□□□□ -1.82
SEC28P40509 SPT6YGR116W 4356 nt3.7□□□□□ -1.82
SEC28P40509 RDI1YDL135C 609 nt3.7□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YDR340WYDR340W 303 nt3.7□□□□□ -1.82
SEC28P40509 CDC12YHR107C 1224 nt3.7□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YPR142CYPR142C 564 nt3.7□□□□□ -1.82
SEC28P40509 PLM2YDR501W 1566 nt3.7□□□□□ -1.82
SEC28P40509 SUC2YIL162W 1599 nt3.7□□□□□ -1.82
SEC28P40509 GCN5YGR252W 1320 nt3.7□□□□□ -1.82
SEC28P40509 TRS120YDR407C 3870 nt3.7□□□□□ -1.82
SEC28P40509 XRS2YDR369C 2565 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 GSC2YGR032W 5688 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 STP1YDR463W 1560 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 APN2YBL019W 1563 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 CHD1YER164W 4407 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 SSL1YLR005W 1386 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YDL162CYDL162C 357 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 AIM6YDL237W 1173 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 RRP17YDR412W 708 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 TAM41YGR046W 1158 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 SOL3YHR163W 750 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YJR111CYJR111C 852 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 AUR1YKL004W 1206 nt3.69□□□□□ -1.82
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