Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DFFAO00273 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DFFAO00273 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DFFAO00273 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DFFAO00273 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DFFAO00273 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DFFAO00273 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DFFAO00273 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DFFAO00273 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DFFAO00273 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DFFAO00273 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DFFAO00273 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DFFAO00273 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DFFAO00273 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DFFAO00273 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DFFAO00273 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DFFAO00273 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DFFAO00273 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DFFAO00273 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DFFAO00273 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DFFAO00273 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DFFAO00273 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DFFAO00273 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DFFAO00273 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DFFAO00273 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DFFAO00273 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DFFAO00273 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DFFAO00273 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DFFAO00273 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms