Protein–RNA interactions for Protein: Q99231

TY1B-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-DR3Q99231 YCR102CYCR102C 1107 nt15.7■□□□□ 0.1
TY1B-DR3Q99231 ADH1YOL086C 1047 nt15.69■□□□□ 0.1
TY1B-DR3Q99231 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt15.67■□□□□ 0.1
TY1B-DR3Q99231 UTH1YKR042W 1098 nt15.67■□□□□ 0.1
TY1B-DR3Q99231 CCA1YER168C 1641 nt15.66■□□□□ 0.1
TY1B-DR3Q99231 CLB6YGR109C 1143 nt15.63■□□□□ 0.09
TY1B-DR3Q99231 YFL054CYFL054C 1941 nt15.62■□□□□ 0.09
TY1B-DR3Q99231 YJL195CYJL195C 702 nt15.62■□□□□ 0.09
TY1B-DR3Q99231 RAX1YOR301W 1308 nt15.61■□□□□ 0.09
TY1B-DR3Q99231 TIR3YIL011W 810 nt15.61■□□□□ 0.09
TY1B-DR3Q99231 PTK1YKL198C 1989 nt15.59■□□□□ 0.09
TY1B-DR3Q99231 HIP1YGR191W 1812 nt15.59■□□□□ 0.09
TY1B-DR3Q99231 AQY2YLL052C 450 nt15.57■□□□□ 0.08
TY1B-DR3Q99231 AAC1YMR056C 930 nt15.57■□□□□ 0.08
TY1B-DR3Q99231 LOT5YKL183W 921 nt15.56■□□□□ 0.08
TY1B-DR3Q99231 NBP35YGL091C 987 nt15.52■□□□□ 0.07
TY1B-DR3Q99231 ZTA1YBR046C 1005 nt15.51■□□□□ 0.07
TY1B-DR3Q99231 CPD1YGR247W 720 nt15.49■□□□□ 0.07
TY1B-DR3Q99231 TIF6YPR016C 738 nt15.48■□□□□ 0.07
TY1B-DR3Q99231 RIB3YDR487C 627 nt15.47■□□□□ 0.07
TY1B-DR3Q99231 ATG15YCR068W 1563 nt15.46■□□□□ 0.06
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TY1B-DR3Q99231 RDN18-2RDN18-2 1800 nt15.44■□□□□ 0.06
TY1B-DR3Q99231 SEN2YLR105C 1134 nt15.43■□□□□ 0.06
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TY1B-DR3Q99231 PUP1YOR157C 786 nt15.41■□□□□ 0.06
TY1B-DR3Q99231 YPI1YFR003C 468 nt15.38■□□□□ 0.05
TY1B-DR3Q99231 YEL008WYEL008W 381 nt15.37■□□□□ 0.05
TY1B-DR3Q99231 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt15.37■□□□□ 0.05
TY1B-DR3Q99231 PRO1YDR300C 1287 nt15.36■□□□□ 0.05
TY1B-DR3Q99231 SWE1YJL187C 2460 nt15.36■□□□□ 0.05
TY1B-DR3Q99231 APT2YDR441C 546 nt15.34■□□□□ 0.05
TY1B-DR3Q99231 DUS1YML080W 1272 nt15.34■□□□□ 0.05
TY1B-DR3Q99231 AKR2YOR034C 2250 nt15.3■□□□□ 0.04
TY1B-DR3Q99231 RIB2YOL066C 1776 nt15.29■□□□□ 0.04
TY1B-DR3Q99231 GND1YHR183W 1470 nt15.28■□□□□ 0.04
TY1B-DR3Q99231 MET28YIR017C 564 nt15.28■□□□□ 0.04
TY1B-DR3Q99231 YML089CYML089C 369 nt15.22■□□□□ 0.03
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TY1B-DR3Q99231 STR3YGL184C 1398 nt15.18■□□□□ 0.02
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TY1B-DR3Q99231 MTG2YHR168W 1557 nt14.91□□□□□ -0.02
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TY1B-DR3Q99231 THI72YOR192C 1800 nt14.88□□□□□ -0.03
TY1B-DR3Q99231 HSP60YLR259C 1719 nt14.83□□□□□ -0.03
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TY1B-DR3Q99231 YER190C-AYER190C-A 576 nt14.74□□□□□ -0.05
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TY1B-DR3Q99231 LIP1YMR298W 453 nt14.5□□□□□ -0.09
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