Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 54.2□□□□□ -1.748e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 43.78□□□□□ -1.88e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.138e-14■■■■■ 40.3
ILF3Q12906 CHPT1-210ENST00000552351 1524 ntTSL 226.69■■□□□ 1.865e-10■■■■■ 40
ILF3Q12906 CHPT1-204ENST00000549128 1552 ntTSL 525.91■■□□□ 1.745e-10■■■■■ 40
ILF3Q12906 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.745e-10■■■■■ 40
ILF3Q12906 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.695e-10■■■■■ 40
ILF3Q12906 CHPT1-202ENST00000546490 476 ntTSL 218.73■□□□□ 0.595e-10■■■■■ 40
ILF3Q12906 CHPT1-206ENST00000550385 754 ntTSL 510.4□□□□□ -0.745e-10■■■■■ 40
ILF3Q12906 CHPT1-208ENST00000552215 4342 ntTSL 1 (best)8.05□□□□□ -1.125e-10■■■■■ 40
ILF3Q12906 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.177e-12■■■■■ 39.7
ILF3Q12906 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.497e-12■■■■■ 39.7
ILF3Q12906 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.556e-9■■■■■ 39.5
ILF3Q12906 NARS2-202ENST00000525345 861 ntTSL 58.47□□□□□ -1.056e-9■■■■■ 39.5
ILF3Q12906 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.336e-9■■■■■ 39.5
ILF3Q12906 CPNE1-209ENST00000415920 731 ntTSL 513.35□□□□□ -0.278e-7■■■■■ 39.4
ILF3Q12906 CPNE1-225ENST00000483495 1853 ntTSL 512.6□□□□□ -0.398e-7■■■■■ 39.4
ILF3Q12906 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.769e-8■■■■■ 39.4
ILF3Q12906 RER1-205ENST00000443438 540 ntTSL 28.16□□□□□ -1.19e-8■■■■■ 39.4
ILF3Q12906 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 520.46■□□□□ 0.879e-8■■■■■ 39
ILF3Q12906 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.299e-8■■■■■ 39
ILF3Q12906 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.159e-8■■■■■ 39
ILF3Q12906 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.179e-8■■■■■ 39
ILF3Q12906 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.329e-8■■■■■ 39
ILF3Q12906 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.168e-8■■■■■ 38.9
ILF3Q12906 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.398e-8■■■■■ 38.9
ILF3Q12906 PRIMPOL-209ENST00000512834 2174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.68e-8■■■■■ 38.9
ILF3Q12906 PRIMPOL-205ENST00000509002 1631 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.78e-8■■■■■ 38.9
ILF3Q12906 PRIMPOL-202ENST00000503752 2168 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.878e-8■■■■■ 38.9
ILF3Q12906 PRIMPOL-203ENST00000506278 1138 ntTSL 1 (best)7.86□□□□□ -1.158e-8■■■■■ 38.9
ILF3Q12906 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.384e-10■■■■■ 38.8
ILF3Q12906 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.927e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.797e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.467e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-218ENST00000454523 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.78■□□□□ 0.287e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.257e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-217ENST00000443231 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.88■□□□□ 0.137e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-207ENST00000361140 2701 ntTSL 1 (best)15.29■□□□□ 0.047e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-221ENST00000476093 1037 ntTSL 315.04■□□□□ -07e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.047e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.047e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.097e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-220ENST00000476027 927 ntTSL 313.73□□□□□ -0.217e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.397e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.47e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-202ENST00000311573 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.657e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.677e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-204ENST00000354691 2498 ntTSL 210.51□□□□□ -0.737e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-215ENST00000436865 2684 ntTSL 1 (best)8.1□□□□□ -1.117e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.127e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 PFKFB4-206ENST00000422701 636 ntTSL 315.27■□□□□ 0.042e-12■■■■■ 38.6
ILF3Q12906 RBPMS-214ENST00000521816 98 ntTSL 31.42□□□□□ -2.182e-11■■■■■ 38.5
ILF3Q12906 SRSF11-209ENST00000463877 617 ntTSL 228.31■■■□□ 2.123e-8■■■■■ 38.3
ILF3Q12906 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.813e-8■■■■■ 38.3
ILF3Q12906 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.233e-8■■■■■ 38.3
ILF3Q12906 TRRAP-205ENST00000456197 11654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.72□□□□□ -1.171e-20■■■■■ 38.3
ILF3Q12906 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.21e-20■■■■■ 38.3
ILF3Q12906 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.211e-20■■■■■ 38.3
ILF3Q12906 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.231e-20■■■■■ 38.3
ILF3Q12906 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.451e-20■■■■■ 38.3
ILF3Q12906 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.918e-10■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.118e-10■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.62e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.432e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.292e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 RREB1-205ENST00000467782 243 ntTSL 516.03■□□□□ 0.162e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.132e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 RREB1-209ENST00000491191 998 ntTSL 513.44□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 RREB1-206ENST00000471433 1021 ntTSL 513.44□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.422e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-216ENST00000560232 1195 ntTSL 211.73□□□□□ -0.532e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-213ENST00000557909 588 ntTSL 410.62□□□□□ -0.712e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-211ENST00000492850 615 ntTSL 59.3□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-214ENST00000559038 557 ntTSL 49.19□□□□□ -0.942e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 RREB1-207ENST00000475946 9067 ntTSL 1 (best)8.63□□□□□ -1.032e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-207ENST00000442313 496 ntTSL 38.3□□□□□ -1.082e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 PGM1-203ENST00000473117 373 ntTSL 57.53□□□□□ -1.22e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-201ENST00000271411 13945 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.352e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-203ENST00000367865 14332 ntTSL 24.86□□□□□ -1.632e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.652e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.652e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.742e-11■■■■■ 38.1
ILF3Q12906 ACLY-209ENST00000590770 583 ntTSL 412.36□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 38
ILF3Q12906 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 38
ILF3Q12906 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.75e-7■■■■■ 38
ILF3Q12906 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -15e-7■■■■■ 38
ILF3Q12906 ACLY-202ENST00000353196 4318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 38
ILF3Q12906 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.075e-7■■■■■ 38
ILF3Q12906 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.042e-11■■■■■ 38
ILF3Q12906 RAB11FIP3-206ENST00000452814 804 ntTSL 515.67■□□□□ 0.12e-11■■■■■ 38
ILF3Q12906 RAB11FIP3-203ENST00000434585 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.55□□□□□ -0.562e-11■■■■■ 38
ILF3Q12906 RAB11FIP3-210ENST00000487899 669 ntTSL 311.16□□□□□ -0.622e-11■■■■■ 38
ILF3Q12906 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.672e-11■■■■■ 38
ILF3Q12906 SLC7A1-202ENST00000450494 547 ntTSL 217.11■□□□□ 0.331e-11■■■■■ 37.9
ILF3Q12906 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.531e-11■■■■■ 37.9
ILF3Q12906 PARN-213ENST00000564904 468 ntTSL 53.48□□□□□ -1.859e-13■■■■■ 37.6
ILF3Q12906 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-10■■■■■ 37.5
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 167.1 ms