Protein–RNA interactions for Protein: Q12439

TY2A-OR1, Transposon Ty2-OR1 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2A-OR1Q12439 PRO1YDR300C 1287 nt9.51□□□□□ -0.89
TY2A-OR1Q12439 COQ2YNR041C 1119 nt9.51□□□□□ -0.89
TY2A-OR1Q12439 IRC24YIR036C 792 nt9.5□□□□□ -0.89
TY2A-OR1Q12439 AIM45YPR004C 1035 nt9.5□□□□□ -0.89
TY2A-OR1Q12439 POM34YLR018C 900 nt9.49□□□□□ -0.89
TY2A-OR1Q12439 RPM1RPM1 483 nt9.49□□□□□ -0.89
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TY2A-OR1Q12439 TOM6YOR045W 186 nt9.48□□□□□ -0.89
TY2A-OR1Q12439 ATG15YCR068W 1563 nt9.48□□□□□ -0.89
TY2A-OR1Q12439 FRE6YLL051C 2139 nt9.47□□□□□ -0.89
TY2A-OR1Q12439 RBG1YAL036C 1110 nt9.47□□□□□ -0.89
TY2A-OR1Q12439 MCH5YOR306C 1566 nt9.46□□□□□ -0.9
TY2A-OR1Q12439 GAP1YKR039W 1809 nt9.45□□□□□ -0.9
TY2A-OR1Q12439 SNF1YDR477W 1902 nt9.44□□□□□ -0.9
TY2A-OR1Q12439 NDI1YML120C 1542 nt9.43□□□□□ -0.9
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TY2A-OR1Q12439 CAB5YDR196C 726 nt9□□□□□ -0.97
TY2A-OR1Q12439 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.99□□□□□ -0.97
TY2A-OR1Q12439 LEU9YOR108W 1815 nt8.98□□□□□ -0.97
TY2A-OR1Q12439 MEP3YPR138C 1470 nt8.97□□□□□ -0.97
TY2A-OR1Q12439 UGA4YDL210W 1716 nt8.96□□□□□ -0.98
TY2A-OR1Q12439 GND1YHR183W 1470 nt8.95□□□□□ -0.98
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TY2A-OR1Q12439 LOT5YKL183W 921 nt8.93□□□□□ -0.98
TY2A-OR1Q12439 GND2YGR256W 1479 nt8.93□□□□□ -0.98
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TY2A-OR1Q12439 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.92□□□□□ -0.98
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TY2A-OR1Q12439 URA6YKL024C 615 nt8.91□□□□□ -0.98
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TY2A-OR1Q12439 SAM2YDR502C 1155 nt8.89□□□□□ -0.99
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TY2A-OR1Q12439 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.84□□□□□ -0.99
TY2A-OR1Q12439 SEC61YLR378C 1443 nt8.82□□□□□ -1
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