Protein–RNA interactions for Protein: Q12242

RUP1, UBA domain-containing protein RUP1, yeastyeast

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUP1Q12242 HEL2YDR266C 1920 nt9.85□□□□□ -0.83
RUP1Q12242 PAU7YAR020C 168 nt9.84□□□□□ -0.83
RUP1Q12242 YCR102CYCR102C 1107 nt9.82□□□□□ -0.84
RUP1Q12242 NAT4YMR069W 858 nt9.81□□□□□ -0.84
RUP1Q12242 ZRT3YKL175W 1512 nt9.81□□□□□ -0.84
RUP1Q12242 THI74YDR438W 1113 nt9.79□□□□□ -0.84
RUP1Q12242 RIM8YGL045W 1629 nt9.78□□□□□ -0.84
RUP1Q12242 YGL114WYGL114W 2178 nt9.78□□□□□ -0.84
RUP1Q12242 SHB17YKR043C 816 nt9.76□□□□□ -0.85
RUP1Q12242 UTR1YJR049C 1593 nt9.75□□□□□ -0.85
RUP1Q12242 MSF1YPR047W 1410 nt9.75□□□□□ -0.85
RUP1Q12242 YDR010CYDR010C 333 nt9.73□□□□□ -0.85
RUP1Q12242 SAM35YHR083W 990 nt9.73□□□□□ -0.85
RUP1Q12242 MUP1YGR055W 1725 nt9.73□□□□□ -0.85
RUP1Q12242 UBA4YHR111W 1323 nt9.72□□□□□ -0.85
RUP1Q12242 LSC2YGR244C 1284 nt9.7□□□□□ -0.86
RUP1Q12242 HOL1YNR055C 1761 nt9.69□□□□□ -0.86
RUP1Q12242 GAP1YKR039W 1809 nt9.68□□□□□ -0.86
RUP1Q12242 RET2YFR051C 1641 nt9.67□□□□□ -0.86
RUP1Q12242 YJL067WYJL067W 351 nt9.66□□□□□ -0.86
RUP1Q12242 YSR3YKR053C 1215 nt9.65□□□□□ -0.86
RUP1Q12242 TIR3YIL011W 810 nt9.63□□□□□ -0.87
RUP1Q12242 PHO89YBR296C 1725 nt9.62□□□□□ -0.87
RUP1Q12242 YGL034CYGL034C 366 nt9.61□□□□□ -0.87
RUP1Q12242 ILV3YJR016C 1758 nt9.6□□□□□ -0.87
RUP1Q12242 YCR087WYCR087W 516 nt9.59□□□□□ -0.87
RUP1Q12242 MAE1YKL029C 2010 nt9.58□□□□□ -0.88
RUP1Q12242 SFA1YDL168W 1161 nt9.58□□□□□ -0.88
RUP1Q12242 DBP1YPL119C 1854 nt9.57□□□□□ -0.88
RUP1Q12242 SHH4YLR164W 507 nt9.57□□□□□ -0.88
RUP1Q12242 XYL2YLR070C 1071 nt9.56□□□□□ -0.88
RUP1Q12242 PRO1YDR300C 1287 nt9.55□□□□□ -0.88
RUP1Q12242 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.55□□□□□ -0.88
RUP1Q12242 HXT1YHR094C 1713 nt9.53□□□□□ -0.88
RUP1Q12242 YNL024CYNL024C 741 nt9.53□□□□□ -0.88
RUP1Q12242 POM34YLR018C 900 nt9.52□□□□□ -0.89
RUP1Q12242 COQ2YNR041C 1119 nt9.52□□□□□ -0.89
RUP1Q12242 MRP20YDR405W 792 nt9.51□□□□□ -0.89
RUP1Q12242 SBA1YKL117W 651 nt9.51□□□□□ -0.89
RUP1Q12242 AIM45YPR004C 1035 nt9.51□□□□□ -0.89
RUP1Q12242 SHY1YGR112W 1170 nt9.5□□□□□ -0.89
RUP1Q12242 DIF1YLR437C 402 nt9.5□□□□□ -0.89
RUP1Q12242 YML089CYML089C 369 nt9.49□□□□□ -0.89
RUP1Q12242 YOR325WYOR325W 474 nt9.49□□□□□ -0.89
RUP1Q12242 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.48□□□□□ -0.89
RUP1Q12242 ATG15YCR068W 1563 nt9.48□□□□□ -0.89
RUP1Q12242 HIS2YFR025C 1008 nt9.46□□□□□ -0.9
RUP1Q12242 RBG1YAL036C 1110 nt9.46□□□□□ -0.9
RUP1Q12242 TOM6YOR045W 186 nt9.46□□□□□ -0.9
RUP1Q12242 OPI10YOL032W 741 nt9.44□□□□□ -0.9
RUP1Q12242 COQ8YGL119W 1506 nt9.44□□□□□ -0.9
RUP1Q12242 ACO2YJL200C 2370 nt9.44□□□□□ -0.9
RUP1Q12242 RPL4BYDR012W 1089 nt9.42□□□□□ -0.9
RUP1Q12242 RPL4AYBR031W 1089 nt9.42□□□□□ -0.9
RUP1Q12242 UGP1YKL035W 1500 nt9.41□□□□□ -0.9
RUP1Q12242 HIP1YGR191W 1812 nt9.4□□□□□ -0.9
RUP1Q12242 YMR209CYMR209C 1374 nt9.4□□□□□ -0.9
RUP1Q12242 URA6YKL024C 615 nt9.4□□□□□ -0.9
RUP1Q12242 CLB6YGR109C 1143 nt9.39□□□□□ -0.91
RUP1Q12242 PEX2YJL210W 816 nt9.39□□□□□ -0.91
RUP1Q12242 ARO8YGL202W 1503 nt9.38□□□□□ -0.91
RUP1Q12242 TIF6YPR016C 738 nt9.38□□□□□ -0.91
RUP1Q12242 YBL086CYBL086C 1401 nt9.38□□□□□ -0.91
RUP1Q12242 RPS14BYJL191W 417 nt9.37□□□□□ -0.91
RUP1Q12242 UTH1YKR042W 1098 nt9.37□□□□□ -0.91
RUP1Q12242 GLR1YPL091W 1452 nt9.36□□□□□ -0.91
RUP1Q12242 CWC15YDR163W 528 nt9.36□□□□□ -0.91
RUP1Q12242 RPM1RPM1 483 nt9.36□□□□□ -0.91
RUP1Q12242 LIP1YMR298W 453 nt9.36□□□□□ -0.91
RUP1Q12242 CCT2YIL142W 1584 nt9.36□□□□□ -0.91
RUP1Q12242 MET2YNL277W 1461 nt9.34□□□□□ -0.91
RUP1Q12242 KES1YPL145C 1305 nt9.33□□□□□ -0.92
RUP1Q12242 SGA1YIL099W 1650 nt9.33□□□□□ -0.92
RUP1Q12242 NRT1YOR071C 1797 nt9.33□□□□□ -0.92
RUP1Q12242 MET28YIR017C 564 nt9.33□□□□□ -0.92
RUP1Q12242 SED1YDR077W 1017 nt9.32□□□□□ -0.92
RUP1Q12242 YMR244WYMR244W 1068 nt9.32□□□□□ -0.92
RUP1Q12242 UFO1YML088W 2007 nt9.32□□□□□ -0.92
RUP1Q12242 YAR028WYAR028W 705 nt9.31□□□□□ -0.92
RUP1Q12242 LEU9YOR108W 1815 nt9.3□□□□□ -0.92
RUP1Q12242 LSB6YJL100W 1824 nt9.28□□□□□ -0.92
RUP1Q12242 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.27□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.27□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.27□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 PET8YNL003C 855 nt9.27□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.27□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.27□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 ZAP1YJL056C 2643 nt9.26□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 BET2YPR176C 978 nt9.26□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 YRF1-2YER190W 5046 nt9.25□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 SAM1YLR180W 1149 nt9.25□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 FIT3YOR383C 615 nt9.25□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 OYE3YPL171C 1203 nt9.25□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 TSC10YBR265W 963 nt9.25□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 PSD1YNL169C 1503 nt9.25□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 YHL008CYHL008C 1884 nt9.24□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 SDH5YOL071W 489 nt9.24□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 SFP1YLR403W 2052 nt9.22□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 MTG2YHR168W 1557 nt9.22□□□□□ -0.93
RUP1Q12242 CYT1YOR065W 930 nt9.22□□□□□ -0.93
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