Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 PLB1YMR008C 1995 nt8.64□□□□□ -1.03
VAM3Q12241 HMG2YLR450W 3138 nt8.64□□□□□ -1.03
VAM3Q12241 DTR1YBR180W 1719 nt8.64□□□□□ -1.03
VAM3Q12241 NBP35YGL091C 987 nt8.64□□□□□ -1.03
VAM3Q12241 NDI1YML120C 1542 nt8.64□□□□□ -1.03
VAM3Q12241 SGT2YOR007C 1041 nt8.63□□□□□ -1.03
VAM3Q12241 ALD4YOR374W 1560 nt8.61□□□□□ -1.03
VAM3Q12241 GTB1YDR221W 2109 nt8.58□□□□□ -1.04
VAM3Q12241 HIF1YLL022C 1158 nt8.58□□□□□ -1.04
VAM3Q12241 PAU16YKL224C 372 nt8.57□□□□□ -1.04
VAM3Q12241 TPO4YOR273C 1980 nt8.56□□□□□ -1.04
VAM3Q12241 PRM5YIL117C 957 nt8.56□□□□□ -1.04
VAM3Q12241 PAU7YAR020C 168 nt8.56□□□□□ -1.04
VAM3Q12241 INA1YLR413W 2028 nt8.54□□□□□ -1.04
VAM3Q12241 SPT20YOL148C 1815 nt8.53□□□□□ -1.04
VAM3Q12241 LSC2YGR244C 1284 nt8.53□□□□□ -1.04
VAM3Q12241 SAM35YHR083W 990 nt8.53□□□□□ -1.04
VAM3Q12241 MIR1YJR077C 936 nt8.51□□□□□ -1.05
VAM3Q12241 TIR3YIL011W 810 nt8.5□□□□□ -1.05
VAM3Q12241 UTR1YJR049C 1593 nt8.5□□□□□ -1.05
VAM3Q12241 GAP1YKR039W 1809 nt8.48□□□□□ -1.05
VAM3Q12241 SHB17YKR043C 816 nt8.47□□□□□ -1.05
VAM3Q12241 ZRT3YKL175W 1512 nt8.46□□□□□ -1.05
VAM3Q12241 YDR010CYDR010C 333 nt8.46□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 RPC82YPR190C 1965 nt8.46□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 UGA4YDL210W 1716 nt8.46□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 THI74YDR438W 1113 nt8.45□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 URA8YJR103W 1737 nt8.45□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 TOK1YJL093C 2076 nt8.44□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 NAT4YMR069W 858 nt8.44□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 UBA4YHR111W 1323 nt8.43□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 HEM14YER014W 1620 nt8.43□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 RET2YFR051C 1641 nt8.42□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 GAL2YLR081W 1725 nt8.42□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 PRO1YDR300C 1287 nt8.41□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 MAE1YKL029C 2010 nt8.41□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.4□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 YML089CYML089C 369 nt8.4□□□□□ -1.06
VAM3Q12241 MSF1YPR047W 1410 nt8.39□□□□□ -1.07
VAM3Q12241 POM34YLR018C 900 nt8.39□□□□□ -1.07
VAM3Q12241 SHH4YLR164W 507 nt8.38□□□□□ -1.07
VAM3Q12241 ATG15YCR068W 1563 nt8.38□□□□□ -1.07
VAM3Q12241 YSR3YKR053C 1215 nt8.37□□□□□ -1.07
VAM3Q12241 PHO89YBR296C 1725 nt8.37□□□□□ -1.07
VAM3Q12241 SFA1YDL168W 1161 nt8.36□□□□□ -1.07
VAM3Q12241 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.35□□□□□ -1.07
VAM3Q12241 YCR087WYCR087W 516 nt8.34□□□□□ -1.07
VAM3Q12241 DIF1YLR437C 402 nt8.32□□□□□ -1.08
VAM3Q12241 HXT1YHR094C 1713 nt8.32□□□□□ -1.08
VAM3Q12241 YJL067WYJL067W 351 nt8.31□□□□□ -1.08
VAM3Q12241 DBP1YPL119C 1854 nt8.31□□□□□ -1.08
VAM3Q12241 YGL034CYGL034C 366 nt8.3□□□□□ -1.08
VAM3Q12241 MRP20YDR405W 792 nt8.28□□□□□ -1.08
VAM3Q12241 COQ2YNR041C 1119 nt8.28□□□□□ -1.08
VAM3Q12241 XYL2YLR070C 1071 nt8.27□□□□□ -1.09
VAM3Q12241 TOM6YOR045W 186 nt8.27□□□□□ -1.09
VAM3Q12241 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.26□□□□□ -1.09
VAM3Q12241 AIM45YPR004C 1035 nt8.25□□□□□ -1.09
VAM3Q12241 THI72YOR192C 1800 nt8.24□□□□□ -1.09
VAM3Q12241 SHY1YGR112W 1170 nt8.24□□□□□ -1.09
VAM3Q12241 HIP1YGR191W 1812 nt8.22□□□□□ -1.09
VAM3Q12241 RIM8YGL045W 1629 nt8.22□□□□□ -1.09
VAM3Q12241 TIF6YPR016C 738 nt8.22□□□□□ -1.09
VAM3Q12241 MUP1YGR055W 1725 nt8.21□□□□□ -1.09
VAM3Q12241 PEX2YJL210W 816 nt8.21□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 YAR028WYAR028W 705 nt8.21□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 LIP1YMR298W 453 nt8.21□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 ILV3YJR016C 1758 nt8.2□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 YGL114WYGL114W 2178 nt8.2□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 RPL4BYDR012W 1089 nt8.2□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 CLB6YGR109C 1143 nt8.2□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 RPL4AYBR031W 1089 nt8.2□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 SED1YDR077W 1017 nt8.19□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 HOL1YNR055C 1761 nt8.19□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 MET28YIR017C 564 nt8.18□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 UTH1YKR042W 1098 nt8.18□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 YBL086CYBL086C 1401 nt8.18□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.17□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 URA6YKL024C 615 nt8.17□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 YNL024CYNL024C 741 nt8.17□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 RSC4YKR008W 1878 nt8.17□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 ACO2YJL200C 2370 nt8.16□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 RBG1YAL036C 1110 nt8.16□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 NRT1YOR071C 1797 nt8.15□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 RPS14BYJL191W 417 nt8.15□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 FRA1YLL029W 2250 nt8.15□□□□□ -1.1
VAM3Q12241 CWC15YDR163W 528 nt8.14□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 SAM1YLR180W 1149 nt8.14□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.13□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.13□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.13□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.13□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.13□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 YOR325WYOR325W 474 nt8.12□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 MAS1YLR163C 1389 nt8.11□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 MTG2YHR168W 1557 nt8.11□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 LEU9YOR108W 1815 nt8.11□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 FIT3YOR383C 615 nt8.11□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 OPI10YOL032W 741 nt8.1□□□□□ -1.11
VAM3Q12241 UFO1YML088W 2007 nt8.09□□□□□ -1.11
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